第九届功能磁共振影像(fMRI)培训班现正接受报名

发布时间:2013-09-11浏览数:2370

各位新老学员:
大家好!
 
      美德医疗在大家的支持和鼓励下,不断推出新的培训课程,多年来连续举办各类fMRI培训班,至今已经第九届了,为各学科人才在科研工作中提供学习和交流等资源共享平台,得到了业内人士的高度肯定,fMRI的培训班已经日趋常规和系统化,每年都会举办至少两期。其中我们很多学员都学有所成,取得了骄人的成绩,我们也倍感欣慰。经过和学员以及几位授课专家总结经验,以后的培训将以专题为目标,深入细致讲解各种技术的原理和应用。本次培训班将以深入学习静息态fMRI技术和多模态融合方法,聘请研究领域最优秀的讲师团队,培训班将保留往届非常受欢迎的数据处理解析,科研思路讲解,学员的互动讨论环节,使得课程更加实用,也为学员中科研人才和临床医生合作搭建桥梁,希望我们在金秋时节一起收获新的知识。
 
现就报名有关事宜说明如下:
 
1. 培训班报到时间为11月21日下午6:00前,晚上开始上课,精彩不容错过。
 
2. 为便于会务安排,报名时请按照回执表认真填写并email给会务组。由于报名名额有限,请学员尽早报名,尽量用电汇的方式提前转帐确认,现场不能刷卡缴费。
 
3.  希望参加发言讨论的学员请尽快报名,将研究摘要以poster形式发给会务组。所有墙报经专家评选出口头报告5-10个,口头报告之后,同时参加poster交流。具体内容可以是已经发表的文章、未发表的初步研究结果,甚至仅仅是研究设计。墙报宽度90厘米,高度120厘米。墙报交流过程中,所有授课专家全程参与,以保证专家与学员、学员与学员的充分交流。
 
 
附:数据处理软件操作培训班调研表:
 
      美德医疗将联手多个研究单位,并依托香港中文大学深圳研究院医学影像研究培训中心,建立数据处理培训中心,配置超高速处理工作站,用于多种fMRI技术所需要的软件上机操作培训。我们将不定期根据报名和需求情况开办实操培训,聘请专业的讲师和博士研究生团队按步骤演示软件的运行,为了了解大家对各软件学习的需求,我们特列出了可能需要学习的各种软件,希望先做一个摸底调查,根据大家的需求权重高低开设课程。请各位学员认真填写并email给会务组。
 
感谢大家对美德医疗的支持,我们将一如既往地坚持培训工作,为大家带来持续学习的机会和专家交流的良好平台。
 
顺祝大家中秋国庆节日快乐,合家团圆!
 
美德医疗
 
2013年9月






第九届功能磁共振影像(fMRI)培训班
              --- 静息态fMRI技术及应用专题
  中国·北京 2013.11.21 – 11.24

主办单位:
 北京中科美德医疗信息科技有限公司
                   深圳市美德医疗电子技术有限公司
                                      
讲师单位:   北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室
                   杭州师范大学认知与脑疾病研究中心
                   中国科学院心理研究所
                   台湾长庚大学医学院
                   耶鲁大学医学院
 
1.    研讨会简介
      功能磁共振影像(fMRI)近年来的发展日新月异,已成为研究认知和临床脑疾病的重要技术。静息态功能磁共振成像(Resting-State fMRI)作为研究静息下人脑自发脑功能活动的重要手段,近十年来得到了快速发展,特别是与之相关的数据分析方法如研究脑区局部特征的方法(ReHo, ALFF等)和研究脑区之间关系的网络分析(Brain network Analysis)等。利用静息态fMRI技术,研究人员能够获取脑局部活动、功能连接、脑网络属性等多维度信息,为全面深入了解认知的神经机制以及神经精神疾病如精神分裂症、老年痴呆症、儿童注意缺陷多动障碍、癫痫、中风、脑外伤等临床问题的神经生理病理学机制提供了重要帮助。
      本次培训班的宗旨是让学员们能够深入了解静息态fMRI技术在国际、国内的最新进展,掌握静息fMRI的基本原理,了解相关的实验设计、影像采集、数据处理、结果解释等方面的知识, 为做出高水平的研究工作提供帮助。本培训班将结合实例,重点介绍静息态fMRI在认知研究和临床实验设计所需要的基本要素以及数据处理相关的统计方法。此外,培训班还将讲授静息态fMRI论文写作中的技巧和注意事项。
本次培训班主要包含三方面内容:
  • 由诸多著名专家学者介绍静息fMRI新技术的基本原理、实验设计、数据分析的最新进展。专家学者结合自身研究方向, 讲解静息fMRI在认知和临床脑疾病研究中的应用。
 
  • 延续以往培训中备受欢迎的“Panel Discussion”环节,全体讲师齐聚讲台,针对静息态fMRI领域中的热点话题以及学员现场的提问,阐述各自不同观点和经验,与大家分享科研心得。
 
  • 由专家学者讲解静息态fMRI科学论文的写作。专家学者将会用亲身经验解悟静息态fMRI相关论文写作的要点和难点, 并且结合自己已发表的论文作为范例,讲解从起草到发表的具体过程。
 
  • 由学员以墙报或口头的形式报告自己的研究方向(自愿参与),并由专家学者做点评。对该活动感兴趣的学员,请提前15天将摘要以poster形式发给会务组。所有墙报经专家评选出口头报告2-3个,口头报告之后,同时参加poster交流。具体内容可以是已经发表的文章、未发表的初步研究结果,甚至仅仅是研究设计。墙报宽度90厘米,高度120厘米。墙报交流过程中,所有授课专家全程参与,以保证充分的专家与学员、学员与学员的交流。此次培训班侧重临床应用,面向所有与脑疾病相关的临床医生以及认知神经科学领域的相关研究人员,大家一定会获益匪浅。
         在金秋时节,在首都北京,我们热忱期待您的光临!
 
 
2.    授课专家
      臧玉峰,1984年于河北医学院医学系获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学获精神病学博士学位。现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心教授。曾从事神经外科工作十余年。近十几年来一直从事静息态功能磁共振计算方法及其在脑疾病的应用研究。合作发表英文论文约90多篇,被SCI引用共3000多次(其中,2012年全年被引用约1000次)。与同事一道,提出了“局部一致性”(Zang et al., 2004, NeuroImage)和“低频振幅”(Zang et al., 2007, Brain Dev)方法。带领研究组开发了针对静息态fMRI的数据处理软件包REST和“流水线”式软件包DPARSF。国际上引用这些软件的英语论文约200篇。目前带领的研究团队包括张寒研究员、廖伟研究员、刘东强副研究员、廖旭红副研究员等人,并与多家单位合作,开展静息态fMRI方法学及其在脑疾病的应用研究,如神经反馈、癫痫、术前术中功能定位、DBS和TMS靶点定位、注意缺陷多动障碍、自发记忆巩固与记忆障碍等。
 
      贺永,博士,国家杰出青年基金获得者,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室研究员(PI),兼任IDG/麦戈文脑科学研究所研究员(PI),博士生导师。目前兼任山东大学、首都医科大学等国内外10余所高校、医院、省部级实验室兼职教授、专家、学术委员等。2005年在中科院自动化研究所获博士学位。2005年至2007年在加拿大麦基尔(McGill)大学蒙特利尔神经学研究所从事博士后研究。2008年回国在北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室工作,担任“计算神经影像与人脑连接组”团队学术带头人。先后主持国家杰出青年基金、国家自然科学基金重点项目、北京市自然科学基金等多项国家和省部级课题。现任国际期刊《Frontiers in Human Neuroscience》、《PLoS ONE》和《Brain Connectivity》编委,美国阿尔茨海默病协会、荷兰阿尔茨海默病协会、法国国家研究署、英国哈德温博士人道研究基金会、国家自然科学基金委等10余个国内外机构的基金评审专家,以及Am J Psychiatry, Ann Neurol, Brain, J Neurosci等30余个国际期刊论文评审人。在PNAS, Brain, Biol Psychiatry, J Neurosci等本领域主流期刊共发表SCI论文105篇,SCI总引用3400余次,H指数28。2009年和2011年获Scopus青年科学家奖(生命科学领域)和国际心理科学联合会APS Observer新星奖。带领团队开发脑网络分析和可视化软件包Gretna和BrainNet Viewer。主要研究领域为计算神经影像与人脑连接组学。详细介绍,请参考http://psychbrain.bnu.edu.cn/teachcms/heyong.htm
 
     毕彦超,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室、IDG/McGovern Institute for Brain Research 研究员、团队带头人(Principal Investigator)。于2006年获哈佛大学心理学系脑、认知、行为专业博士学位。作为首席科学家主持973计划青年项目,是国家自然科学基金委优秀青年基金获得者,担任北京神经科学学会理事。主要围绕语言和语义记忆的认知神经基础进行研究,作为通讯作者在Brain, Journal of Neuroscience、Cortex、NeuroImage、Brain and Language等国际心理学和神经心理学杂志发表多篇论文。曾获Sackler Scholars Programme in Psychobiology奖项和国际心理科学联合会新星奖。
 
      刘鹤龄,教授,博士,台湾长庚大学医学院,医学影像暨放射科学系教授,台湾长庚医院放射诊疗部特聘顾问。毕业于台湾清华大学物理系,2000年于美国德州大学获医学物理博士,从事血液灌注之计算方法与fMRI的技术研究。完成博士学位后返回台湾工作,与临床放射科、神经内外科、复建科、精神科、眼科及中医多位医师专家合作,进行磁共振临床研究课题,并持续与大陆及香港多位杰出心理学家合作,在神经科学领域有新的探索。目前共发表有70余篇SCI论文,并为NeuroImage, Human Brain Mapping, MRM, JMRI等知名期刊审稿。2004年获RSNA/AAPM资助至德州安德森癌症中心完成一年临床影像物理Residency训练,并通过考试获美国放射专科(ABR)认可诊断医学物理师资格。2010年至加州大学圣地亚哥分校Center for Functional MRI半年,研习最新的ASL技术,期望将之推广于临床研究。
 
      王菲,医学博士,耶鲁大学医学院精神科助理教授。主要研究兴趣为多模态影像学在重性精神疾病中的应用。在精神医学,神经科学以及影像医学杂志(American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry, Brain等)发表SCI论文近50篇。先后获得NIMH职业发展奖 K01, 两次NARSAD青年研究员奖, Klingenstein Fundation 青年研究员奖。为20多个国际杂志审稿,并参加中国国家自然科学基金委、美国National Institute of Healthy、以及英国Medical Research Council等基金的评审。
 
      左西年,博士(应用数学),中国科学院心理研究所研究员,博士生导师,中科院“百人计划”入选者,国际“千人功能连接组计划”方法学支撑,国际“神经影像数据联盟”咨询团成员。主要研究领域为人脑功能连接组学及其应用,主要研究方向:1)静息态功能磁共振计算方法及其重测信度,2)人脑功能连接组发展轨线。最近五年在国际学术期刊发表学术论文50篇,其中13篇为第一和/或通讯作者,13篇发表在神经影像方法学领域国际最高水平的杂志NeuroImage上,被引1178次(他引1076次),年均引用236次,H指数18。第16届国际人脑成像年会做大会口头报告(2010),获NeuroImage解剖与生理编辑选择奖(2010),受邀在剑桥大学“网络与连接组论坛”做1小时报告(2012)。现任国际期刊《公共科学图书馆-综合》(PLoS ONE)学术编委和统计编委、《脑成像方法前沿》(Frontiers in Brain Imaging Methods)评审编委;NeuroImage, Human Brain Mapping, Journal of Neuroscience, Archives of General (JAMA) Psychiatry, American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry,Neuroscience & Biobehavorial Reviews等30余个专业期刊审稿人;荷兰Marie Curie国际基金、A-star新加坡国立大学-美国杜克大学联合基金评审专家、英国医学研究理事会(MRC)基金评审专家;目前主持国家自然科学基金面上项目、国际重大合作项目、中国科学院重点部署项目和中国科学院仪器设备功能开发技术创新项目各一项。详细信息请参见课题组网站:http://lfcd.psych.ac.cn/index.html 和http://scholar.google.com/citations?user=a3-gVGMAAAAJ&hl=en
 
      龚高浪,国家自然科学优秀青年基金获得者,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室研究员,博士生导师。2006年毕业于中科院自动化所,获博士学位,2006-2010赴加拿大Alberta大学、Mcgill大学从事博士后研究,2011年至今在北师大认知神经科学与学习国家重点实验室工作。荣获scopus“青年科学之星”(生命领域),入选北京市科技新星计划。主要从事基于结构与弥散磁共振神经影像的活体脑连接与脑网络研究,已在本领域权威期刊(如Journal of neuroscience, cerebral cortex, neuroimage等 )发表SCI论文多篇,相关研究工作得到了国内外同行的广泛关注和高度评价,发表论文已被SCI引用超过700次。获批软件著作权3项(如PANDA软件),发明专利1项。 现任PLoS ONE学术编辑(academic editor),国家自然科学基金项目、中荷联合科研主题(JSTP)项目评审专家,并担任多个国际期刊审稿人,现承担多项国家级科研项目(如国自然面上项目、科技部973(青年科学家项目)科研骨干、国家社科基金重大专项子课题负责人等)。
 
      夏明睿,博士,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室科研助理。主要研究方向为静息态脑功能网络的计算方法,及其在神经精神疾病中的应用,脑网络可视化等。在国际期刊发表SCI论文数篇,编写了脑网络绘制软件BrainNet Viewer,下载量达5000余次,用该软件绘制图片的期刊封面文章5篇。曾获认知神经科学与学习国家重点实验室优秀学术成果奖、教育部博士研究生学术新人奖等。
 
      3.    课程安排 
20131121日(晚上7:00开始):warmup course
  • Step-by-step processing and analysis of R-fMRI data (Mingrui Xia&Xinian Zuo)
 
20131122日(上午8:30开始):
  • R-fMRI: biophysical mechanisms of BOLD imaging (Anthony Liu)
  • R-fMRI: introduction of resting-state BOLD fMRI (Yufeng Zang)
  • Multi-modal integration: R-fMRI and perfusion MRI (Anthony  Liu)
  • R-fMRI: pre-processing steps and relevant considerations (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: local activity --method and applications to brain disorders and memory consolidation (Yufeng Zang)
  • R-fMRI: seed-based connectivity analysis--methods and applications  (Mingrui Xia)
  • Panel discussion: R-fMRI technique—experimental design and data analysis
 
20131123日:(830)
  • R-fMRI: ICA-based connectivity analysis --methods and applications (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: graph-based network analysis--methods and applications (Yong He)
  • R-fMRI: studying cognition (Yanchao Bi)
  • R-fMRI: studying neuropsychiatric disorders (Fei Wang)
  • Panel discussion: R-fMRI connectivity analysis and applications
  • Student: Oral presentation
 
20131124日(下午400结束):
  • Multi-modal integration: R-fMRI and diffusion MRI (Gaolang Gong)
  • R-fMRI packages: analysis and visualization tools (Mingrui Xia)
  • How to write R-fMRI papers (Yong He)
 
以上报告均以中文授课
4.    备注
¨        培训费:每人3000元(提供“培训费”正式发票),包括培训费、资料费、餐费; 交通及住宿费用自理。
¨        培训地点:北京市圆山大酒店(北京市西城区裕民路2号)。
¨        学员住宿地点:北京市圆山大酒店  标准双人间:300元/间/天(150元/人/天)
¨        全体学员于2013年11月21日下午在北京市圆山大酒店大堂集中报到,21日晚
上19:00开始上课,22-24日全天培训,课程于24日下午4时结束。
¨        最终课程安排以报到当日发放的课程表为准。
¨        报名方法:电话或电子邮件均可,最好以电话确认。
¨        培训班限额招生,为便于会务安排,报名敬请从速。
¨        报名截至日期:2013年11月10日
为便于会务安排,报名敬请从速!
   北京报名点:
   联系人:周丹 
           联系电话: 13683079540
          Email: zhoudan@sinorad.com
 
    深圳报名点:
            联系人:应敏 
            联系电话: 13632680220
            Email: yingmin@sinorad.com
 
 
交费方法:会议前银行转账或现场交现金(现场不能刷卡)
如通过银行汇款,请将学费汇至下列账号(注明:2013北京fMRI培训班):
户 名:北京中科美德医疗信息科技有限公司
开户行:中国建设银行北京阜成路支行
账 号:11001085400059610940
 
北京市圆山大酒店路线图:
地址:北京市西城区裕民路2号
酒店联系电话: 010-62023328,62010033
 
 



神经影像分析软件培训计划survey
常用软件及功能列表
  功能 领域
子领域
软件名称
功能简述
 兴趣 指数*
DTI
 
DTI studio
DTI Studio是一个在Windows下运行的扩散张量图像后处理程序。适合张量计算,颜色映射,白质纤维束跟踪,三维可视化等任务。
 
MedInria
MedINRIA是由法国INRIA开发的医学影像后处理平台。包含医学影像可视化,DTI纤维束跟踪与张量显示,图像配准,多硬化症分析,脑沟回可视化等功能。
 
FSL
FSL偏重于DTI的统计学处理分析。
 
TBSS
TBSS是FSL软件下的一个DTI数据处理工具,主要用于比较不同组人群之间局部FA或其他DTI参数的差异,与VBM或VBA比较相近,但所使用的算法完全不同,是目前DTI数据中比较常用的软件之一。
 
TrackVis
TrackVis是一款多平台DTI数据处理软件,可以在Windows系统或Linux系统下使用,可用于计算计算纤维束走形和显示非常方便的软件。该软件由两个工具箱构成,Diffusion Toolkit用于计算DTI或HARDI数据以及常用的各参数,如ADC、FA、本征值等。TrackVis用于对计算出的神经纤维束显示和分析,可以手工画ROI或VOI也可以通过导入ROI或VOI进行纤维束追踪,并可分析通过ROI的纤维束数目及长度等信息。是目前比较好用的一款DTI数据处理软件,上手比较容易。
 
脑结构连接分析
PANDA
PANDA是基于FSL等软件开发的dMRI数据处理软件。它可以全自动地对大量的被试进行预处理,并产生用于voxel-based、atlas-based和TBSS-based统计分析所需的数据;此外可以通过确定性追踪和概率追踪进行网络构建。软件可以同时并行分析大批量的数据。(www.nitrc.org/projects/panda/)
 
fMRI
静息态fMRI
REST
REST是一个静息态功能磁共振数据分析工具,可以计算功能连接(FC),区域同质性(ReHo值),振幅低频率波动(ALFF),Granger因果分析(GCA)等指标。同时包含丰富的图像分析工具,如各种统计分析、可视化,多重比较校正,时间序列提取,结果出图等。
 
FSL - MELODIC
FSL MELODIC 3.0是牛津大学开发的一个功能磁共振后处理软件。该方法无需指定任何先验模型,凭借独立分量分析(ICA)将单个或多个四维数据集分解成不同的空间和时间组件,从而寻找活跃区域。
 
GIFT
基于Matlab的专门用来做ICA分析的工具包,可以用来进行基于任务fMRI和静息fMRI的ICA分析及其后续分析。
 
MICA
基于Matlab的易于操作的ICA分析软件。可以实现较大样本量数据的ICA分析,通过多次运算求得稳定的ICA分析结果,克服ICA分析的不稳定性。
 
DPARSF(A)
流水线式自动化的fMRI和静息态fMRI数据预处理,静息态fMRI数据后处理工具包。可以实现目前主流的各种静息态fMRI指标的计算。可以实现并行的快速计算。
 
任务态fMRI
SPM
SPM是分析功能成像数据教主流的一个软件包。可以分析多种脑成像数据,包括fMRI,PET,SPECT,EEG和MEG。
 
GLM Flex
基于Matlab和SPM的二次统计(组分析)分析软件,除了SPM包括的那些简单模型(单样本,双样本t检验等),还允许更多功能如mixed ANOVA,2×2被试内设计,多于两因素的ANOVA分析。
 
FSL-FEAT
FSL FEAT基于模型的fMRI数据分析软件, FEAT对于实验设计和分析具有很高的灵活性,适合于复杂的功能磁共振实验设计任务。
 
AFNI
AFNI是在linux上运行的分析功能成像数据的工具集。可以分析多种脑成像数据,包括fMRI,PET,SPECT等。
 
 
LISREL
LISREL (Linear Structural Relations)是由K.G. Joreskog & D. Sorbom所发展的结构方程模型 (Structural Equation Modeling)软件. LISREL被认为是最专业的结构方程模块(Structural Equation Modeling, 简称 SEM )分析工具,通过fMRI数据可以对大脑进行网络模型构建(带有方向性),并对所做模型供验证性因素分析。由于LISREL在探讨多变项因果关系上的强力优势,最早LISREL运用于社会学研究,最近随着脑科学研究的进展也有不少研究人员将结构方程模型运用于大脑网络的研究进而探讨多变项或单变项之间的因果关系。
 
Structural MRI
皮层
Freesurfer
FreeSurfer是哈佛大学开发的磁共振神经影像分析,主要用于测量大脑皮层的厚度和统计分析。
 
沟回
BrainVISA
BrainVISA 可以用来分析T1加权大脑MR图像,包括灰/白质分类,左右半球表面的提取与可视化,大脑皮质沟回的提取、标记等。
 
结构
SPM
测脑体积、VBM、及其他
 
多模态磁共振数据分析
脑网络分析
GRETNA
GRETNA是一个针对磁共振影像数据开发的基于图论的复杂脑网络分析软件。该软件可以对脑功能影像进行自动预处理,并能批量计算常用的二值化或者加权脑网络的拓扑属性,如类聚系数、最短路径长度、小世界属性、网络效率、模块化、节点度、节点介数、节点效率等,并能对结果进行统计分析(www.nitrc.org/projects/gretna)
 
脑网络可视化
BrainNet Viewer
BrainNet Viewer是一个脑网络可视化软件,提供了丰富的设置来帮助研究者快速、灵活、方便地展示脑连接网络的信息。该软件支持显示基于图论的三维脑网络模型以及体数据到三维脑曲面的映射,并能够将显示结果保存成常用的图片格式或制作展示电影动画(www.nitrc.org/projects/bnv/)
 
多功能平台
3D slicer
3D Slicer是一个开放式的医学影像后处理平台,可以创建特定主题的医学图像分析和可视化工具。包含
多种模态成像如MRI,CT,超声,核医学等,可以分析从头部到脚的多个器官影像,具有较好的可扩展性。
 
 
FSL
测体积、VBM、及其他
 
 
*兴趣指数:1-5:  1=最不想学,5=最想学




 
第九届功能磁共振影像(fMRI)
---静息态fMRI技术及应用专题培训班(2013.11.21-24 中国?北京)


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